黄南州南部有高山绵延，北部河谷纵横，地形复杂，交通方式较为单一，目前没有航空和铁路交通，唯一进出黄南的交通方式便是公路了。
黄南州内交通以州府同仁县隆务镇以及黄南所辖的泽库、尖扎、河南三县县城为中心，分别有隆（务）黄（乃亥）公路、隆（务）兰（采）公路、隆（务）加（吾）公路、马（克唐）措（周）公路、马（克唐）康（扬）公路、夏(德日)宁(秀)公路、夏(德日)和（日）公路、多（福屯）恰（力曲）公路、多（禾茂）大（久塘）公路以及泽（库）同（德）公路等州内公路干线相连接，州府同仁长途汽车站每天有数趟发往州内及周边县市的班车，省内可达西宁、潢中、互助等城市，省外可到甘肃临夏、夏河等地。
黄南州府同仁县内公交车较少，出租车较为便宜，市内一律为3元；而众多的面的、摩的在市区也随处可见。
此外，州府同仁还有通往李家峡、甘肃夏河的旅游专用公路，进出黄南，取道甘肃夏河、临夏，也是十分便捷。